Un estudio metagenómico reciente ha revelado un espectro notablemente diverso de virus y bacterias que portan los roedores en la provincia de Heilongjiang, incluidos el virus Lassa, el virus Amur, la Salmonella y la Yersinia pestis.
La investigación utilizó elKit de enriquecimiento de ARN de patógenos de Macro & Micro-TestBasado en la tecnología de captura de sondas, este método, mediante la eliminación selectiva del ARNr del huésped y otros fragmentos conservados, retuvo eficazmente el ARN microbiano, mejorando significativamente la sensibilidad de detección de patógenos. Este paso de enriquecimiento de ARN patógeno fue fundamental para lograr una alta tasa de detección y brindó un sólido respaldo técnico para la vigilancia de patógenos.
Roedores: principales reservorios de enfermedades zoonóticas
Los roedores son el grupo de mamíferos con mayor diversidad de especies y de distribución más amplia, ya que comprenden más de 2000 especies en todo el mundo y representan más del 40 % de todas las especies de mamíferos.
Más allá de su importancia ecológica, los roedores sirven como importantes reservorios y vectores de numerosos patógenos zoonóticos.Debido a que los hábitats de los roedores a menudo se superponen con los entornos humanos —a través de mordeduras directas, contacto con excrementos o transmisión indirecta mediante pulgas y ácaros—, los patógenos que albergan representan una amenaza persistente para la salud pública.
Cabe destacar que más del 70% de las enfermedades infecciosas emergentes tienen su origen en la fauna silvestre, siendo los roedores uno de los reservorios virales más importantes.
Región fronteriza de Heilongjiang: una línea de frente para la vigilancia de patógenos.
Heilongjiang, provincia fronteriza del noreste de China, posee abundantes recursos ecológicos y comparte frontera con varios países. La combinación de una rica biodiversidad y el frecuente movimiento transfronterizo de población crea condiciones favorables para la transmisión de patógenos.
Entre junio y julio de 2021, los investigadores recolectaron 67 roedores silvestres en la ciudad de Hengdaohezi, Mudanjiang. Las muestras incluyeron:
l 20Península de Apodemus
l 47Myodes rufocanus
Todos los ejemplares fueron capturados en zonas residenciales y terrenos agrícolas circundantes, lo que pone de manifiesto la estrecha relación entre los asentamientos humanos y los hábitats de la fauna silvestre.
Tecnología de enriquecimiento de patógenos: superando la interferencia de fondo del huésped
En la secuenciación metagenómica, el ARN del huésped suele predominar en las lecturas de secuenciación, enmascarando las señales de patógenos de baja abundancia.
Para abordar este desafío, el estudio empleóKit de detección metagenómica de patógenos de Macro & Micro-Test. Mediante la tecnología de captura de sondas, se utilizan sondas diseñadas específicamente que se unen al ARNr del huésped y a secuencias conservadas, lo que permite su eliminación y, por lo tanto, el enriquecimiento del ARN microbiano.
Este enfoque mejoró sustancialmente la sensibilidad en la detección de patógenos, lo que permitió que la secuenciación posterior recuperara una mayor proporción de lecturas de patógenos. El paso de enriquecimiento sentó las bases para caracterizar con precisión el espectro de patógenos que portan los roedores.
Tras el enriquecimiento, las muestras de ARN se sometieron a transcripción inversa, construcción de bibliotecas y secuenciación de alto rendimiento. El análisis bioinformático incluyó:
Filtrado del genoma del huésped
Clasificación taxonómica mediante Kraken2
Corrección de abundancia con Bracken
Este flujo de trabajo generó un perfil completo de las comunidades virales y bacterianas.
Resultados de la investigación: Circulación simultánea de múltiples virus y bacterias.
Hallazgos virales
Los virus detectados pertenecían a 21 familias virales, entre ellas:ArenaviridaeyHantaviridae.
A través dede novoMediante el ensamblaje con Megahit, se generaron 154 contigs virales, de los cuales 110 se alinearon con 19 virus de ocho familias.
In Península de ApodemusSe identificaron los siguientes virus:
l Arenavirus: virus Lassa, virus Wenzhou, virus Gairo
l Hantavirus: virus Amur, virus Puumala
In Myodes rufocanusSe detectaron el arterivirus de la rata y el virus Amur.
Entre estos patógenos:
El virus de Lassa es un agente causal de la fiebre hemorrágica viral, con tasas de letalidad que alcanzan aproximadamente el 20%.
El virus Amur es uno de los patógenos responsables de la fiebre hemorrágica con síndrome renal (FHSR). China registra la mayor carga mundial de infecciones por hantavirus.
Hallazgos bacterianos
Se anotaron un total de 1.051 géneros bacterianos.
Los géneros más abundantes fueron:
lSalmonela(26–31%)
lYersinia(11–23%)
SalmonelaEs un importante patógeno transmitido por los alimentos, responsable de aproximadamente 9 millones de casos de fiebre tifoidea y unas 110.000 muertes anuales en todo el mundo.
Yersinia pestisEl agente causal de la peste ha sido responsable de tres pandemias históricas. La provincia de Heilongjiang es reconocida como uno de los focos naturales de peste en China y sigue siendo una región prioritaria para la vigilancia epidemiológica.
Importancia del estudio
Contribuciones científicas
Este estudio representa el primer informe de fragmentos del virus Lassa y del virus de la arteritis de la rata en roedores de Heilongjiang, lo que amplía la base de datos de patógenos transmitidos por roedores en China.
Este estudio caracteriza sistemáticamente las comunidades virales y bacterianas en las poblaciones locales de roedores, proporcionando datos de referencia para la vigilancia de enfermedades zoonóticas en las regiones fronterizas.
Implicaciones para la salud pública
Los hallazgos resaltan la necesidad de vigilancia continua y detección de patógenos.Península A.yM. rufocanus.
Los datos proporcionan evidencia científica que respalda las estrategias de control de la fuente de contagio para enfermedades como la peste y la fiebre hemorrágica con síndrome renal.
Fortalezas metodológicas
La secuenciación metagenómica permite la detección imparcial de patógenos tanto conocidos como nuevos.
En este estudio, la tecnología de enriquecimiento de patógenos de Macro & Micro-Test demostró un rendimiento sólido, mejorando eficazmente la detección de patógenos objetivo en muestras biológicas complejas. Los resultados confirman su capacidad para respaldar la identificación de patógenos de alta sensibilidad en la vigilancia de la fauna silvestre.
Recomendación de producto
Basándose en su exitosa aplicación en este estudio, el kit de enriquecimiento de ARN de patógenos Macro & Micro-Test es altamente recomendable para la investigación de vigilancia metagenómica.
Al eliminar eficazmente los ácidos nucleicos del huésped y enriquecer las secuencias microbianas, el kit mejora significativamente la sensibilidad de detección y la calidad de los datos. Representa una herramienta esencial para la detección precisa de patógenos en muestras complejas y proporciona un sólido apoyo técnico para la vigilancia de la salud pública, la evaluación del riesgo zoonótico y la preparación ante brotes epidémicos.
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Fecha de publicación: 2 de marzo de 2026