Un estudio reciente publicado enMicrobiomaSe realizó un análisis metagenómico viral en 846 pequeños mamíferos silvestres —incluidos murciélagos, roedores y musarañas— recolectados en Sierra Leona, África Occidental. El estudio identificó un total de 39 virus de ARN asociados a mamíferos, de los cuales 26 eran nuevos y 13 ya conocidos. Entre ellos, la familia Paramyxoviridae presentó la mayor diversidad, mientras que los roedores albergaban el mayor número de especies virales (n = 26).
La evaluación del riesgo zoonótico reveló tres virus zoonóticos conocidos: el virus de la encefalomiocarditis, el virus de Lassa y el Rocahepevirus sp., así como tres virus con riesgo potencial de transmisión: el virus de Melian, el virus de la hepatitis de roedores y el Hunnivirus A. Cabe destacar que, entre los virus recientemente identificados, el Bat ledantevirus 2 mostró la relación filogenética más cercana al virus Le Dantec, que infecta a los humanos. El análisis serológico detectó además anticuerpos neutralizantes contra este virus en el 2,8 % de los residentes locales, lo que sugiere una exposición humana previa, probablemente no detectada.
Estos hallazgos resaltan la presencia de un importante reservorio viral dominado por roedores en África Occidental y subrayan la importancia crucial de las estrategias de vigilancia integradas en la interfaz humano-animal. La combinación del análisis metagenómico con la validación serológica proporciona un marco sólido para identificar virus con potencial zoonótico y de transmisión entre especies.
En la última década, más del 60 % de las enfermedades infecciosas emergentes en humanos se han originado en reservorios animales, siendo los murciélagos, roedores y musarañas los principales huéspedes de virus zoonóticos. África es ampliamente considerada un foco de enfermedades zoonóticas. Por ejemplo, Sierra Leona notificó más de 28 000 casos durante el brote de ébola de 2014-2016.
A pesar de la importante carga de enfermedades zoonóticas en esta región, la diversidad y distribución de virus en pequeños mamíferos silvestres aún no se conocen lo suficiente. Para abordar esta deficiencia, los investigadores realizaron un análisis sistemático del viroma de 846 pequeños mamíferos silvestres capturados en tres sitios de Sierra Leona entre 2018 y 2023. El estudio tuvo como objetivo caracterizar la diversidad viral, identificar virus con potencial de transmisión entre especies, evaluar el riesgo zoonótico y generar evidencia para respaldar los sistemas de alerta temprana de enfermedades infecciosas emergentes.
Métodos básicos
El estudio aplicó un flujo de trabajo integral de metagenómica viral:
- Procesamiento de muestras:Se recolectaron tejidos de corazón, hígado, bazo, pulmón y riñón, se agruparon, se homogeneizaron y se sometieron a extracción de ARN total.
- Secuenciación y ensamblaje:Se realizó la eliminación del ARN ribosómico antes de la construcción de la biblioteca, seguida de una secuenciación de alto rendimiento utilizando la plataforma Illumina NovaSeq 6000. Los contigs virales se ensamblaron de novo.
- Identificación del virus:Los virus se identificaron mediante la alineación del gen de la ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp). Solo se conservaron los virus asociados a vertebrados, excluyendo los virus bacterianos, fúngicos y vegetales.
- Análisis bioinformático:Se llevaron a cabo reconstrucciones filogenéticas, análisis de recombinación, modelado de redes de transmisión entre especies y evaluación del riesgo zoonótico.
- Validación serológica:Se desarrolló un ensayo de neutralización de pseudovirus basado en VSV para el ledantevirus 2 de murciélago. Se detectaron anticuerpos neutralizantes en el 2,8% de los sueros humanos, lo que proporciona evidencia de una posible transmisión zoonótica.
EstudiarResultados
1. Descubrimiento viral y diversidad
Este estudio realizó un análisis de secuenciación transcriptómica en 846 animales silvestres recolectados en Sierra Leona, incluyendo roedores, murciélagos y musarañas. Basándose en las secuencias completas del gen de la ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp), se identificaron un total de 39 virus de ARN asociados a mamíferos, de los cuales 13 eran virus previamente conocidos y 26 eran virus nuevos.
En cuanto a la composición viral, la familia Paramyxoviridae presentó el mayor nivel de diversidad en los tres órdenes de hospedadores, seguida de Astroviridae y Picornaviridae. Respecto a la distribución de hospedadores, los roedores aportaron la mayor diversidad viral, albergando un total de 26 especies de virus, lo que indica su papel fundamental como reservorios de diversidad viral en la región.
2. Riesgo zoonótico
La evaluación del riesgo zoonótico identificó tres virus zoonóticos conocidos: el virus de la encefalomiocarditis, el virus de Lassa y especies de Rocahepevirus. Además, se identificaron tres virus —el virus Melian, el virus de la hepatitis de roedores y el Hunnivirus A— con potencial riesgo de transmisión zoonótica.
Entre los 26 virus recién descubiertos, se predijo que cuatro tendrían un alto potencial zoonótico según sus características filogenéticas y genómicas. En particular, el ledantevirus de murciélago 2 mostró la relación filogenética más cercana al virus Le Dantec, conocido por infectar a los humanos.
Las investigaciones serológicas posteriores confirmaron este hallazgo, ya que se detectaron anticuerpos neutralizantes contra el ledantevirus 2 de murciélago en el 2,8 % de los sueros de los residentes locales. Este resultado sugiere que podrían haberse producido infecciones no detectadas o asintomáticas en la población humana, lo que pone de manifiesto una posible vía de transmisión zoonótica hasta ahora desconocida.
3. Dinámica de transmisión entre especies
El análisis de la transmisión entre especies demostró que los roedores ocupan una posición central dentro de la red de intercambio viral, actuando como nodos clave que facilitan el intercambio de virus entre especies hospedadoras. Se identificaron un total de 15 virus con potencial de transmisión entre especies.
Un análisis más detallado de los patrones de transmisión entre órdenes taxonómicos indicó que la transmisión viral ocurría con mayor frecuencia entre huéspedes del mismo orden taxonómico, lo que sugiere que el parentesco entre huéspedes influye significativamente en la dinámica de transmisión. En contraste, los murciélagos mostraron una capacidad relativamente menor para la transmisión entre órdenes taxonómicos.
Es importante destacar que se observaron indicios de expansión del rango de hospedadores en ciertos virus. Por ejemplo, el virus de Melian, que anteriormente se consideraba específico de las musarañas, también se detectó en roedores en este estudio, lo que indica un posible cambio en la adaptabilidad del hospedador y un mayor riesgo de transmisión a otros animales.
Conclusiones e implicaciones para la salud pública
- Alta diversidad del viroma en pequeños mamíferos salvajes:El descubrimiento de 39 virus de ARN, incluidas 26 especies nuevas, revela un gran reservorio de virus en la región e informa por primera vez sobre nuevos virus con alto potencial zoonótico (por ejemplo, el ledantevirus de murciélago 2).
- Los roedores como objetivos prioritarios de vigilancia:Los roedores actúan como focos clave de transmisión viral y portan la mayor diversidad viral, lo que representa el mayor riesgo de contagio.
- Necesidad de estrategias de vigilancia integradas:Los resultados respaldan la priorización de los roedores en los programas de vigilancia activa y la implementación de enfoques integrados que combinen metagenómica, serología y monitoreo ecológico en las interfaces entre humanos y vida silvestre.
En general, este estudio proporciona evidencia fundamental para respaldar los sistemas de alerta temprana y los marcos de evaluación de riesgos para las enfermedades zoonóticas emergentes, reforzando la importancia de la vigilancia proactiva en las regiones de alto riesgo.
Información del producto
Fecha de publicación: 23 de marzo de 2026